智能物流仓储系统是以立体仓库和配送分拣中心为产品的表现形式，由立体货架、有轨巷道堆垛机、出入库托盘输送机系统、检测浏览系统、通讯系统、自动控制系统、计算机监控管理等构成，综合了自动化控制、自动输送、场前自动分拣及场内自动输送，通过货物自动录入、管理和查验货物信息的软件平台，实现仓库内货物的物理活动及信息管理的自动化及智能化，变传统的静态仓库为现代的动态仓库。
医药生产是最早运用智能物流仓储系统的领域之一，1993年广州羊城制药厂建成了国内最早的医药生产用自动化立体库。此后，吉林敖东、东北制药、扬子江制药、石家庄制药、上药集团等数十个企业成功运用自动化立体库。
智能物流仓储系统，可以解决医药行业仓库管理的诸多问题：
1、立体仓库的建造高度可以达到20米以上，可以充分利用空间，减少仓库面积；
2、减少人为因素；
3、仓库管理软件WMS，能够成熟的与上位管理系统如ERP等无缝联接。数据能够双向交换；
4、维修方便，维护简单，价格便宜。一座仓库投入使用有一年的保修期。一年后进入维护期，以后每2～6月巡检一次。每半年进行一次检修。即可保证仓库的正常使用；
5、立体仓库还可以改善公司对外形象；
6、在功能分区方面，立体仓储有着比平面库灵活的处理方式：如对于合格品与待验品，系统会采用虚拟分区的方式，产品检验合格后，系统会根据收到的合格指令，把待验品区转化为合格品区，而不需要移动货物；
对于合格品与不合格品，系统采用物理分区的方式，系统分配一定的物理分区专用于不合格品存放，产品检验不合格，系统根据收到的不合格指令，自动将产品移到不合格品专用存放区；对于液体原辅料、固体原辅料、容易串味的中药材，系统也会根据产品特性，分配固定的物理货位给相应的物料进行存储。
